A ação do Apostolado Mundial de Fátima na sua vertente internacional é coordenada por um Conselho de Administração. Deste fazem parte nove membros eleitos em assembleia-geral por um mandato de quatro anos. Os membros do Conselho representam os vários centros regionais do Apostolado Mundial de Fátima. Reúnem-se uma vez por ano para discutir os assuntos internos da associação e definir o plano pastoral. São assistidos pelo Secretariado Internacional.
O Apostolado Mundial de Fátima tem como seu Moderador Eclesiástico o Bispo titular da diocese de Leiria-Fátima.
Nas eleições de 2016, data da última assembleia-geral, foram eleitos para o Conselho de Administração, as seguintes pessoas:
Presidente: Prof. Américo López-Ortiz, Porto Rico
Vice-Presidente: Sr. George Inglin, Suiça
Tesoureiro: Sr. Reynald Andales, Filipinas
Secretário: Dr. Celcio Dias, Índia
Conselheiros:
- Eng. Hana Francakova, Republica Checa
- Pe. Desmond Farren, Irlanda
- Sr. David Carollo, EUA
- Sr. Oliver Abasolo, Inglaterra
- Prof. Michael Ogunu, Nigéria
Conselho de Administração