A ação do Apostolado Mundial de Fátima na sua vertente internacional é coordenada por um Conselho de Administração. Deste fazem parte nove membros eleitos em assembleia-geral por um mandato de quatro anos. Os membros do Conselho representam os vários centros regionais do Apostolado Mundial de Fátima. Reúnem-se uma vez por ano para discutir os assuntos internos da associação e definir o plano pastoral. São assistidos pelo Secretariado Internacional.

O Apostolado Mundial de Fátima tem como seu Moderador Eclesiástico o Bispo titular da diocese de Leiria-Fátima.

Nas eleições de 2016, data da última assembleia-geral, foram eleitos para o Conselho de Administração, as seguintes pessoas:
Presidente: Prof. Américo López-Ortiz, Porto Rico

Vice-Presidente: Sr. George Inglin, Suiça

Tesoureiro: Sr. Reynald Andales, Filipinas

Secretário: Dr. Celcio Dias, Índia

Conselheiros:

• Eng. Hana Francakova, Republica Checa
• Pe. Desmond Farren, Irlanda
• Sr. David Carollo, EUA
• Sr. Oliver Abasolo, Inglaterra
• Prof. Michael Ogunu, Nigéria

Conselho de Administração