A ação do Apostolado Mundial de Fátima na sua vertente internacional é coordenada por um Conselho de Administração. Deste fazem parte nove membros eleitos em assembleia-geral por um mandato de cinco anos. Os membros do Conselho representam os vários centros regionais do Apostolado Mundial de Fátima. Reúnem-se uma vez por ano para discutir os assuntos internos da associação e definir o plano pastoral. São assistidos pelo Secretariado Internacional.
O Apostolado Mundial de Fátima tem como seu Moderador Eclesiástico o Bispo titular da diocese de Leiria-Fátima.
Nas eleições de outubro de 2022, data da última assembleia-geral, foram eleitos para o Conselho Internacional de Administração, as seguintes pessoas:
Presidente: Prof. Michael Ogunu, Nigéria
Vice-Presidente: Reynald Andales, Filipinas
Tesoureiro: David Kelly, EUA
Secretário: Edith Koch, Suiça
Conselheiros:
- Oksana Bodak, Ucrânia
- Pe. Damian Maria, Coreia do Sul
- Pe. MV Sunni, India
- JR Pereira, Samoa
- Walter Karger, Alemanha
Conselho Internacional de Diretores 2022-2027