Les affaires internationales de l'Apostolat Mondial de Fatima sont coordonnées par le Comité Exécutif, qui se compose de 9 membres de l'Apostolat Mondial de Fatima, élu par le Conseil international, pour un mandat de cinque ans. Chaque membre du comité exécutif représente également un des centres régionaux de l’AMF.
Le Comité Exécutif se réunit une fois par année, pour discuter les affaires internes du mouvement et pour définir le plan pastoral. Ils sont assistés par le secrétariat international.

Le modérateur épiscopal de l’Apostolat Mondial de Fatima est l’évêque actuel de la diocèse Leiria-Fatima, en Portugal. 
En octobre 2022, la date de la dernière Assemblé Générale, on a élu les suivants personnes pour le Comité Exécutif international:

Président:Prof. Michael Ogunu, Nigeria
Vice-président: Reynald Andales, Philippines
Trésorier: David Kelly, EUA
Secrétaire: Edith Koch, Suisse
Conseillers:

• Oksana Bodak, Ukraine
• Fr. Damian Maria, Corée du Sud
• Fr. MV Sunni, Inde
• JR Pereira, Samoa
• Walter Karger, Allemagne

Comité Exécutif International 2022-2027